ó en su defecto bajarle la opacidad para que me permita ver lo que hay por debajo
No uso VB, pero de lo que recuerdo, no podrias cambiar las propiedades de visible?
Eso directamente haria que desaparezca el PictureBox, Si tu problema es que queres que el Picture Box aparezca sobre el video pero apenas visible, seria cambiar el "opacity"
https://stackoverflow.com/questions/24817235/change-opacity-in-picturebox
del mismo. Se me ocurre eso si es que tenes una imagen con fondo transparente (png) y pones de background trasparente tambien. El problema ahi es que se veria la imagen.
Pero nuevamente, si lo queres hacer desaparecer por completo le sacas el visible, y si queres que se vea apenas le cambias la opacidad.
PictureBox + con imagen de fondo trasparente: