Hola.
Si se puede amigo, yo lo he hecho para hacer un control de fase, cuando detecto el flanco con la interrupcion CCP1 habilito las interrupciones con el Timer0, una vez el Timer0 hace lo que tiene que hacer lo deshabilito dentro de la interrupcion del Timer0 y espero al proximo flanco para volverlo a activar desde CCP1
Saludo