jojo que cosa rara!
A mi me pasaba algo similar, cuando tocaba la carcasa que tenia los drivers sin tener el puerto conectado, a veces se movían algunos motores, esto es porque no tenia un estado lógico definido a la entrada de la interfaz en las señales de paso y dirección, con lo cual tomaba cualquier ruido al no tener el cable de la pc que definía los estados, esto lo solucione usando resistencias pull down en las entradas, pero evidentemente tu problema difiere y mucho de esto.
No se como tengas armado el sistema, pero si es modular, proba utilizando cables lo mas cortos posibles entre ellos, supe tener un par de problemas con eso.
La verdad no se me ocurre mas nada,
Saludos y conta como te a ido jeje