Pues muy sencillo, si no utilizas una tabla de paginación fat en una SDCard está no podrá ser leida en tu PC como si fuese una tarjeta normal, con lo que tendrías que conectar el pic a la sd y al PC y pasar datos de la sd al pic y del pic al pc. Por lo que si usas fat con conectar la sd al ordenador podrás leer los datos directamente.
Un saludote.