A los 99mm de z hay que restarle lo de la fresa no?
No, ahi estas herrado, yo por ejemplo tengo en el Z guias de 199mm y como el carro es de 100mm me queda un recorrido en ese eje de 99mm, los datos de los otros ejes también son los recorridos reales que va a tener.
No entiendo porque decis eso de restar la fresa??? supongo te referías al carro del eje Z, en ese caso ya esta restado los 100mm que roba, eso si, el diseño tiene que ser tal que con el eje Z arriba del todo la fresa este en la parte mas baja del puente que sostiene el Z y este tiene que tener un despeje de 99mm al menos para qu valga la pena los 99mm de recorrido.
En tu caso 200mm en Z, si el carro es como el mio de 100mm vas a necesitar guías de 300, y tenes que garantizar un despeje de al menos 200 mm entre la base donde se sujetan las cosas a mecanizar y la parte mas baja del puente, con lo cual vas a tener mucho brazo de palanca, te conviene evaluar hasta donde vale la pena llevar tanto el eje Z.
Si queres mucho recorrido en Z por el tema de las palancas te conviene dejar el puente fijo y mover la mesa, o sino un diseño tipo mesa cruz y el Z independiente al costado tipo las fresadoras de banco.
Saludos