Que tal, te molesto si me das mas información acerca de las versiones que estas utilizando para el MPLAB y el PIC Basic Pro.
Esto debido a que la version de Pic Basic Pro solamente trabaja en conjunto con el MPLAB version 5.7.
Para las versiones 6.10 en delante del MPLAB necesitarás las version 2.44 de PIC Basic Pro, además de bajar un parche desde la web de los creadores del PIc Basic Pro.
Saludos.