Hola Joseh, yo he trabajado mas que nada con isocam pero teóricamente creo que es lo mismo.
Te voy ha hablar de isocam, tu puedes hacer todo tu diseño en isocam, pero es muy complicado ya que es un programa generico, cuando yo hago un PCB por ejemplo, creó los ficheros geber en mitad, eagle, altium... donde están las pistas, pad etc. Pero la maquina CNC necesita las cordenadas, no de las pistas, si no de lo que no es cobre, para que la fresa pase por esa zona y no por el cobre.
Es como si en una impresión te qudas con lo blanco y no con lo negro. Hay es donde entran programas como isocam, o como artcam. metes los gerber y generas el archivo de milling que es precisamente por donde tiene que pasar la fresa para dejar el cobre.
No se si me he explicado bien.
Un saludo