Hola, gueork y bienvenido.
La verdad es que es bien raro lo que comentas...y eso del annotate es la primera vez que lo veo...y yo he simulado sin problemas....
No se, así a primeras y sin ver el circuito ni tener más datos, no se me ocurre más que pensar que has puesto un led no simulable.
En Proteus existen modelos simulables y otros no... no pongas el que solo pone led, porque ese no es simulable, pon cualquier otro p.e. led-red o led-blue... a ver si con eso consigues simular algo...
En cuanto a lo de la alimentación, en el menú grafico "generator" puedes poner cualquier tipo de fuente para alimentar el circuito. Pero por ejemplo con ciertos elementos como pics o lcd´s no hace falta darles alimentación, el proteus ya entiende que para que funionen tienen que ir a 5v y no hace falta alimentarlos, simulan perfectamente sin alimentación...
No se.... mira a ver este pequeño tutorial a ver si puedes solucionar alguna cosilla más con él:
http://usuarios.lycos.es/arsabe75/index.htmlUn saludo.