Hola, como estás:
Revisa primero el hilo "como filtrar interferencias"...
Adelantándome a lo que puedas encontrar ahí es recomendable lo siguiente:
* Colocar capacitores de bypass, estos capacitores deben ser de tantalum que poseen bajo ESR (Resistencia Equivalente en Serie), aunque problamente por la frecuencia de la que hablas no lo requiera pero no está de más, mejor que sobre a que falte. Estos capacitores los debes colocar entre la alimentación y el plano de tierra lo más cercano posible de CADA INTEGRADO. Cada Ic debe tener su capacitor de bypass -el efecto es que envía las señales de alta frecuencia directo al camino de la tierra.
* Capacitores de desacople: Estos se colocan en paralelo a la salida de laa fuente de alimentación, en este caso tu fuente conmutada. Lo que hace es que le aumenta la impedancia de entrada a tu circuito para las altas frecuencias, su valor promedio (el usual) es de 100uf. También puedes usar para desacoplar el circuito un inductor a la salida de la fuente, pero en serie, el valor de estos los desconosco, no los he usado.
En general, cuando he hecho proyectos con fuentes conmutadas, he usado los planos de tierra separados. Para los caminos de retorno (de tierra) uso una conexión estrella, uso los capacitores de tantalum entre alimentación y tierra cerca de los circuitos, y los capacitores a la salida de la fuente para desacoplar. Es recomendable si puedes encontrar una nota de aplicación (Aplication Note) en la página de microchip, donde explique como tratar estos.
Saludos, espero que tengas éxitos. Suerte!
Andros!