Hola RodrigoAndres, los 2N7000 no te serán de utilidad ya que poseen una resistencia Rdon demasiado elevada, es del orden de los 7 ohms, por lo que 2 en paralelo sería como 3.5 ohms, eso sumado a que tu tienes 350mA de consumo, genera una disipación de potencia de 0.42W (no tanta) y una caída de tensión de 1.225V (demasiada).
Con lo anterior, si a tu circuito lo alimentaras con 5V el micro solo estaría recibiendo 3.775V. lo cual no creo que sea aceptable. Y mucho peor la situación si lo alimentaras solo con 3.3V
Por que en ves de complicarte tanto la vida, no usas simplemente un diodo del tipo 1N5819 o cualquier diodo schottky de 1A o más? Este diodo iría en serie con el circuito y en el polo positivo. Este tipo de diodo, con esa corriente solo te produciría una caída aproximada de 0.2V
Igual, lo del mosfet no es buena idea, ya que deberás de buscar uno que no posea diodo damper (el IRF540 si tiene diodo damper) ya que si no en inversa conduciría este diodo y no tiene sentido la aplicación, más allá de lo anterior, con una polarización en inversa podrías quemarlo y dejaría de cumplir la función en cuestión.
Básicamente y para resumir, el mosfet no es posible usarlo tal como deseas hacerlo. Y donde lo hallas leído, pues están muy mal informados. Y la resistencia que mencionas se coloca en el SOURCE del mosfet y en ambos mosfet. Esta resistencia se usa para equilibrarlos, y en tu caso tampoco es recomendable porque incrementarías aun más la caída de tensión.
Un saludo.
Atte. CARLOS.