Eso ocurre a veces porque hasta que no ha insertado un componente no dispone de toda la información sobre sus pines.
Si das "Validate" en lugar de "Execute", y no hay otro componente igual ya insertado en la PCB, puede ocurrir que no reconozca los pines.
Por eso cuando lo ejecutas de verdad, primero inserta el componente y luego, al llegar al paso que estaba fallando, ya no falla.