Hola Edwin_pe
Puedes cambiar el pad del componente que quieras, incluso puedes cambiar un padstack solamente de un componente si lo prefieres, para hacerlo en la version que mencionas debes hacer lo siguiente:
Con el diseño abierto en el layout, seleccionas PIN TOOL en la barra de herramientas, luego seleccionas "E" edit en la misma barra, te aparece una ventana "edit layer" donde te pregunta en que capa quieres trabajar, usualmente está bien seleccionada la capa donde tienes las pistas o los pad's, ahora eliges el pad que quieres cambiar, seguidamente haces click derecho y eliges "ENd Command" con esto ya le dijimos que pad era y lo liberamos, ahora vas a "view spreadsheet" y eliges "padstacks" ahora vas a notar que te abre una ventana con varios datos seleccionados en color negro, eso que ves seleccionado es el pad que vos antes elegiste, arriba de esa selección negra haces click derecho y pones propiedades, te abre una ventana que se llama "edit padstack"
y colocas la medida del pad en pad width y pad height, por ejemplo 2 (y ya puedes ver en el diseño como ha cambiado la medida de dicho pad.-
saludos
Hernán
PD: esto es solo una manera de hacerlo, hay mas formas.-