Lo que podria hacerse es tratar de reducir las amplitudes de esas señales, sumar las entradas con algun AO, luego restarlas y luego un comparador para que la diferencia sease compare con una tension fija..
Todo eso imagino que desde la parte analogica, y aun asi deberias tener algo que "mantenga" la salida en un estado hasta que pase cierto tiempo, lo cual va depender exclusivamente de la velocidad que necesites tener
Por el lado digital, tener un micro el cual tome con el ADC los valores y finalmente sumarlos dentro del micro y compararlos y de ahi actuar. es lo mas simple en termino de la cantidad de materiales y la poca necesidad de ajuste.
Luego hay que ver si cada salida es idependiente, y que no se puedan unir las masas de cada salida. O si estan unidas, si hay que optoacoplar la salida. Etc. Pero ahi tenes un panorama de lo que haria al menos yo.