Es por que una de las reglas dice que la maxima altura es de 25.4mm
Como el cuerpo de tu componente ( cuando creaste el footprint o el modelo 3D ) tiene 37.5mm y supera el maximo de la regla te da como resultado esa violacion a la misma.
Estando en la hoja de PCB, anda a Design - Rules...
Abajo dice Placement - Height, presiona el "+" y elegi el Height que esta dentro. Ahi tenes los minimos, maximos y preferido de todos los componentes.
Aumentale el maximo a 40mm y no tendrias mas esa violacion a la regla