Lo primero que tendrias que hacer es definir:
1.- Las variables de entrada y Salida
2.-Universo de discucion de cada variable.
3.-Funciones de pertenencia (Triangular, Gausiana, Trapezoidal, etc)
4.-Metodo de defusificación (Dado lo limitado del hardware es recomendable utilizar el método de centroides y evitar a toda costa la integracion numerica)
Lo siguiente seria plantear las ecuaciones para el procedimiento de fusificación segun el tipo de funcion de pertenencia que hayas decidido usar, de todas formas te puedo decir que en la ayuda del ToolBox "Fuzzy Logic" de Matlab estan dichas ecuaciones, la matematica involucrada es pura geometria plana.
Entonces en el programa lo que debes hacer es, leer las variables de entrada, fusificarlas, hacer la implicacion, evaluar las reglas y defusificar.