Buenas,
A ver, Allegro se podría resumir como el "sustituto" del Orcad Layout (a partir de la próxima version de Cadence ya no existira el Layout). Es un "pcb editor" como su propio nombre indica. Es mucho más completo y potente que el Orcad Layout.
Por otro lado, specctra es un software de rutado (principalmente es para autorouting) integrado en el mismo paquete. Implemente unas técnicas de autorutado increibles. No hay que confundirlo con specctraquest, que es otro software del paquete que se encarga de la hacer los estudios de integridad de la señal (integrado dentro de allegro si la licencia lo incluye)...
Espero haberte aclarado las cosas...
Un saludo,