Seguramente se podrá, pero seguramente será un coñazo. La ventaja de soldar con aire es hacerlo con muchos componentes de manera simultánea, barriéndolos con el chorro de aire. Esos componentes se quedan adheridos a la PCB gracias a la propiedad cremosa del estaño. Con estaño en hilo no lo podrás hacer.
Para usar estaño en hilo, es mejor soldar con el lápiz.
De hecho, casi todo lo que yo sueldo es SMD y lo hago con el lápiz. Prácticamente sólo uso el aire para soldar los QFN y para desoldar.