En Windows/Projects habilitas la ventana donde ves los archivos de tus proyectos. Allí por ejemplo en Source Files, con el botón derecho del mouse realizas un click y se despliega un menú, en ese menú seleccionas Add Existing Item, seleccionas tu archivo fuente.
Si los archivos no está en la carpeta del proyecto debes agregar el Path correspondiente, para ello en la misma ventana de Projects realizas click con el botón derecho pero en el proyecto, vas a propiedades, XC8, Include Directories y lo agregas como corresponde. Yo tengo instalado C18, y en lugar de XC8 dice mc18
Saludos!
