pues lo unico que intente para unir hojas separadas si te refieres a diseños en otros archivos, yo lo que hize fue usar "file" -> "Export Selection..."
y luego cargaba eso a mi otro Diseño y lo simulaba, pero renombraba los nombres de los componentes, salu2, la verdad no se usar mucho el Proteuz he usado pocas veces simuladores, unos diseños solamente pero lo básico mas lo pruebo en protoboard o implementados, salu2