
En esa imagen ves que en Tools - Design Rule Manager
Ahi podes limitar todo a una sola capa, poniendo todo en el bottom layer.
En la solapa design rules podes elegir las distancias entre pad-pad, pad-camino , etc.
En la otra solapa Net Classes ahi tenes por default 2, POWER y SIGNAL, ahi elegis el tamaño de vias/caminos, en la imagen esta por DEFAULT
Si queres agregar mas clases creo que en el esquematico a los "cables" wires tenes que ponerle de nombre Class=NOMBRE_DE_CLASE