Hola
El problema es que vos hiciste un polígono (PoligonPlane), pero estás modificando la regla PlaneClearance que es para planos.
Tenés que diferenciar, un polígono no es un plano.
Un polígono es una superficie determinada que cubrís con cobre y le asignas una Net.
Un plano, normalmente se usa en diseños multicapas, y son capas internas que cubren toda la superficie de tu PCB y a las que normalmente se les asigna Vcc o GND.
Para hacer lo que querés hacer, tenés que ajustar la regla Clearance. Tendrás que crear una regla de este tipo de prioridad alta y que solo afecte a tu polígono.
Saludos.
Luis