Yo no utilice el simulador de MPLAB, directamente uso la herramienta de VSM... Creo que deberia ser lo mismo. Te pregunto, cual es el motivo por el cual no actualizas el XC8?
Ninguno, tengo el v1.43 y el 2.x (no recuerdo el numero)
Respecto del timer si yo conocía que tiene un buffer, pero imagine (y asumí mal) que esto tenia que tener en cuenta al cargar ese registro.. Es que ante la duda siempre lo cargue de forma separada (la parte alta de la baja)