¡Saludos al foro!
Me respondo a mí mismo:
Probando distintas opciones he encontrado la siguiente:
Utilizamos o creamos un pad normal con el diámetro interior igual al taladro que necesitamos. Lo ponemos en el lugar adecuado y en propiedades lo cambiamos a la capa Drill. Ésto hace que elimine el cobre de las capas Sup e Inf.