No está bien usado el typedef, debió ser:
typedef struct {
int mi_Var_A;
float mi_Var_B;
long mi_Var_C;
} Mi_Estructura ;
Mi_Estructura Variable_A;
Mi_Estructura Variable_B ;
De todas maneras, CCS no te acepta una comparación (u operación aritmética) sobre la estructura completa.
Sí te acepta una asignación
Variable_B = Variable_A;