Hola arielmdq, esa pequeña variación de pulsos probablemente ya sea la propia variación de velocidad de motor, o sea es de esperar que el propio motor no posea una velocidad estable al 100 %
A mi parecer, para estabilizar la lectura y no perder velocidad, ya se debe de usar otro método de medición de las RPM. O sea en ves de contar X cantidad de pulsos por RPM deberíamos de medir el tiempo entre cada pulso, o sea medimos la velocidad angular del, en este caso alternador, y calcular sus RPM, como el alternador "tira" varios pulsos por cada RPM ya tendríamos más datos para promediar y la propia lectura de por sí sería más estable.
Por supuesto, es solo mi opinión. Por todo lo demás, me alegra que esté funcionando como lo deseas, realmente le as puesto mucha garra y te lo mereces. FELICIDADES !!!
Un saludo.
Atte. CARLOS.