He recibido tu fichero y a mí sí me sale la Bottom layer, así que será cosa de tu Altium.
En cualquier caso, como bien dice ema, puedes configurar a tu gusto lo que necesites imprimir, utilizando "insert printout" para generar una nueva página, y "insert layer" para introducir capas en esa página.
De todas formas, para enviar tu proyecto a que te lo fabriquen, no te recomiendo hacerlo así, sino generando los Gerbers. Esto es lo que yo hago siempre:
- File -> Fabrication outputs -> Gerber files: en la capa Layers marco todas las capas, exceptuando las capas mecánicas, donde sólo marco aquella que lleva el corte de la PCB. No marco ninguna capa mecánica en la parte derecha, donde pone "Mechanical layers to Add to All Plots".
- File -> Fabrication outputs -> NC Drill Files: aquí dejo las opciones por defecto
Y luego meto en un RAR todos los ficheros generados y los envío al fabricante.
Por cierto, he visto que te falta definir la capa mecánica de corte de la PCB. Debes dibujarlo en una nueva, porque la 1, la 2, la 13 y la 15 las tienes ocupadas con distintos elementos. Bastará con que pintes una línea cerrada alrededor de todo el borde para que la CNC sepa por donde cortar.