Hola elgarbe, usa dos diodos en serie con cada una de las alimentaciones, diodos de baja caída tales como el 1N5819. La fuente de 5V externa debe ser completamente aislada, porque de lo contrario pasará lo que dice juaperser1. Las masas deben de estar unidas completamente, si resistencias de por medio ni nada, de lo contrario esto producirá una caída de tensión importante que puede afectar el desempeño del circuito en general.
Para saber si la fuente externa es completamente aislada, pues conecta la fuente a 220V, en la salida de masa conecta una resistencia de 1K a tierra y mide la tensión en los bornes de la resistencia, si la tensión medida es de 0V o muy próxima, pues la fuente es completamente aislada.
Si cumples con estas consignas, pues pueden estar USB y fuente conectadas al tiempo y todo funcionará de maravillas.
Un saludo.
Atte. CARLOS.