Bueno, despues de romperme un poco la cabeza con este tema, me di cuenta de que es mas simple de lo que parecia.
Comento el resultado por si a alguien le sive.
El lector lee y envia el numero por RS-232. El pic recibe el dato y lo compara con uno que tiene grabado en la memoria. Si es igual, continua el ciclo, y si es diferente dispara un rele y una alarma.
Para grabar el dato en la memoria, activo un interruptor, que hace que el pic entre en otra subrutina. Ahi le pido que realice 5 lecturas consecutivas y las compare. Si son iguales, enciende un led verde y graba ese numero en la memora y lo usa para comparar. Si no son iguales, enciende un led rojo y pide otra vez 5 lecturas.
La aplicacion es para leer codigos de barras de estuches, en la alimentacion de una maquina estuchadora automatica de una industra farmaceutica. Asi, en caso de mezcla involuntaria de estuches (lo que desde el punto de vista de calidad farmaceutica puede considerarse una catastrofe) el equipo para solo y advierte al operador.
Saludos
Dario