Hola frasquito, poco se puede apreciar por el escaso tamaño de la foto, pero de lo que se puede ver, yo haría las siguientes modificaciones:
* Con respecto al carro que formaría parte el eje Y, o sea lo veo muy alto, las guías del eje Y están demasiado alejadas de las guías del eje X y estas guías deben de estar lo más próximas posibles entre ellas para evitar al máximo el momento de torsión. Por lo tanto te recomendaría tratar de reducir esta altura al máximo posible, por supuesto siempre cumpliendo las especificaciones deseadas.
* Para los motores del eje X mi ideología es siempre mejor usar un motor grande a usar dos más pequeños, la idea de sincronizar dos motores no me simpatiza y no creo que sea una solución 100% confiable, en cambio usar un motor grande y luego por poleas dentadas, cadenas, etc. sincronizar ambos husillos es algo que si bien es un poco más complejo de implementar, una ves terminado y bien ajustado es 100% confiable y de una muy larga vida útil.
* Si solo se trabajará madera en el equipo CNC, pues yo sin dudas fabricaría la máquina en aluminio o hierro. De desear trabajar metales no férreos, sin dudas la construiría en hierro. Metales ferreos no lo recomiendo. Dependiendo del país donde te encuentres, se puede llegar a conseguir perfilería de aluminio de calidad, de no estar seguro de dicha perfilería, sin dudarlo construiría el equipo con perfilería de hierro del tipo estructural, muy liviana y resistente tanto a flexiones y demás, aparte de un costo muy accesible y fácil de trabajar. Madera completamente descartada por las fuerzas implicadas, vibraciones y demás que aparecerán durante el funcionamiento de la máquina.
* Lo primero que deberás de conseguir es el motor de la herramienta (motor spindle), o sea el motor que hace mover la herramienta de corte, ya que este motor es el elemento de mayor masa a mover por todos los ejes, y en base a este diseñar todo los demás elementos del equipo CNC. No vale de nada construir toda la máquina y al momento de montar el motor de la herramienta darte cuenta que no entra en el lugar definido, o le sobra mucho espacio y darte cuenta que todo está muy sobre o sub dimensionado.
* Se que es prototipo, pero el soporte que realizaste para el motor spindle, desde ya te comento que es muy débil, debes de hacerlo mucho más robusto, porque si no te ocasionará problemas de vibraciones que en casos extremos pueden ser fatales, fatiga de materiales con las consiguientes quebraduras o fisuras en la estructura. Aparte de la mala terminación o baja calidad del trabajo.
* Motor spindle, no busques la solución "económica o rápida", ten en cuenta que en una fresadora CNC este motor no solo debe de podérsele controlar las RPM (aunque sea de manera manual), si no que también es un motor que estará sometido a muchas horas de trabajo continuo. Motores de router manuales o de amoladoras de mano son para uso muy intermitente y sus rodamiento en muy pocas horas de uso empiezan a tomar olguras importantes. Aparte de ser motores con escobillas o carbones que tienen una determinada vida útil corta para esta aplicación y en muchos (por no decir todos) de los casos poseen una ventilación deficiente sobre todo a bajas RPM.
Creo que por ahora tienes suficiente material para "procesar", sería interesante que puedas subir una foto con mayor resolución de la maqueta que realizaste.
Un saludo.
Atte. CARLOS.