ah, ok, ya entendí... entonces creo que tus señales están bien y se ven feas porque el osciloscopio está mal configurado.
Solo estás viendo la componente alterna de la señal ac.. para ver señales cuadradas, deberías configurarlo para ver ac + dc
Normalmente se accede a esto abriendo el menú del canal 1 por ejemplo y en la opción "acoplamiento"(o "coupling" si está en inglés), seleccionar la opción dc
Lo mismo para el canal 2.
Saludos