Unos puntos que se me ocurren:
1. Esos cables de alimentación son bastante largos y finos. Si mides las tensiónes de entrada y salida directamente en el PCB, te encontrarás con una tensión más baja que los 12V de la fuente y más cercana todavía a la tensión de salida.
2. El diseño de circuitos conmutados requiere trazar las pistas a mano con mucho cuidado de respetar las directrices generales para ese tipo de circuitos. Infórmate antes un poco o postealo. Si intentas hacer el circuito de ejemplo lo más parecido a como va a ser en la realidad, mejor.
3. Cuando hay baja tensión de entrada en el circuito integrado, este simplemente intenta conmutar el máximo tiempo posible el transistor de salida. Si pones la señal de conmutación en el osciloscopio podrás ver que está el 90 y muchos por cien del tiempo en alto y muy poco tiempo bajo. La conmutación se debe hacer siempre para poder cargar el condensador que alimenta al mosfet canal N.
Todo esto no le cuesta ningún trabajo extra al circuito, no más que con cualquier otra tensión de entrada. Por lo tanto es seguro.
