El Eagle está en todas partes. Es el estandar actual.
Por otro lado, la versión free tiene limitaciones y la full tiene costos importantes (también si se te ocurre piratearlo, te costará quitar todo el malware)
A mi me gusta más KiCad. Es gratuíto, de código abierto y cada día gana más usuarios. Ya me he acostumbrado a su funcionamiento y no tiene casi nada que envidiar al Eagle.
Una crítica que le hacen a KiCad es que separa símbolos eléctricos del layout. A mí personalmente eso me gusta mucho. Cuando dibujo el esquema, puedo colocar un PIC18F4550 sin preocuparme de su encapsulado.
Más adelante, antes de diseñar el PCB, puedo decidir si el encapsulado es un PDIP 40 o uno de montaje superficial: TQFP 44 ó QFN 44
Saludos.