El problema de esos picos está en el montaje o en el osciloscopio. No es problema del circuito.
Echando algunos cálculos:
Periodo entre picos inferiores de unos 60 a 65ns. La frecuencia:
T = 65 ns
f = 1 / T = 15.4 MHz
A esa frecuencia tan alta la regulación no funciona y los picos de tensión dependen de la impedancia de los condensadores.
Para condensarores de 100nF será:
Zc = 1 / (2·pi·f·C) = 1 / (2 · 3.1416 · 15.4MHz · 0.1 uF) = 1/ 9.68 = 0.103 Ohms
Es muy baja y deberían eliminar el pico de tensión.
Otro cálculo:La tensión sube 0.48 voltios en 30ns. Para conseguir ese cambio, un condensador de 100nF necesita una corriente de:
I = C · dV / dT = 100nF · 0.48V / 30ns = 1.6 Amperios
Si pones dos o tres condensadores, el pico debería reducirse en la misma proporción.
A esa frecuencia los electrolíticos tienen una respuesta más pobre (o la misma, pero necesitan mayor capacidad):
https://upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/d/d4/Kondensator-Impedanzverl%C3%A4ufe-Wiki-1.jpg
Quizás mirando señales de entrada / salida y regulación desde la masa de potencia, puedes encontrar algo raro.
De todas formas si mejora con unos electrolíticos en paralelo, la parte práctica ya la tienes terminada.
Un saludo.