Hola elgarbe, 5.5 cm2 lo veo muy poco y más si el conjunto va dentro de un gabinete estanco. Si el conjunto irá en gabinete estanco, yo recomendaría un disipador de aluminio de unos 20 cm2 (40 cm2 de superficie total)
Igual, recuerda que el diodo también debería estar montado en disipador, porque si usas un diodo tipo schottky la potencia a disipar será de aprox. 2W y ni hablar de un diodo tipo fast.
Con respecto a la PCB, pues primer error, que la corriente saliendo del fusible este "obligada" a pasar por los condensadores, o sea que los condensadores se encuentren entre el fuse y la bobina. Como está en la salida sería lo correcto.
Cable de alimentación de entrada con una sección mínima recomendada de 1.5 mm2. 1 mm2 es posible usarlo, pero el mismo produciría una caída de tensión considerable.
Otro tema, yo siempre hablo teniendo en cuenta que la corriente de salida máx. será de 4A, Está en ustedes querer "apretar" más los componentes.
Con las resistencias, 3 de 0.33 ohms 2W sería un shunt de 0.11 ohms 6W, correcto para nuestro uso, ahora 2 de 0.27 ohms 2W serían un shunt de 0.135 ohms 4W y si bien los ohms son aceptables, pues nos quedamos cortos con la potencia, ya que el máximo a disipar se encuentra muy próximo a los 5W.
Un saludo.
Atte. CARLOS.